產品概述

數據的分析、整理與查詢都依賴于數據庫,專業數據庫將在科研工作中為研究人員提供極大的便利。目前,古奧基因自主研發了QTL數據庫、RNA表達數據庫、DNA變異數據庫三大基因類數據庫,并協助用戶構建企業或實驗室私有數據庫。

產品列表

  • QTL數據庫

  • RNA表達數據庫

  • DNA變異數據庫

QTL數據庫

數量性狀基因座數據庫,通過公司自主研發的QTL數據提取流程,將每個物種的QTL數據從文獻中提取出來,再對QTL數據進行整理,將同一染色體區域的QTL通過標記位置信息進行集中。創建了物理圖譜與遺傳圖譜對應的可視化工具,協助研究人員獲取控制數量性狀的QTL在基因組中的位置,尋找合適的候選基因。

性狀索引 檢索跟蹤,自動更新

用戶可以根據性狀分類檢索、匹配到對應分類的QTL數據,高效追蹤候選基因,數據庫數據會隨著相關文獻的發表自動更新。

可視化圖譜 圖譜定位,區間展示

支持繪制物種QTL遺傳圖譜和物理圖譜,展現染色體上marker和QTL的定位信息,協助用戶快速定位QTL區間,并給出區間內的基因列表。

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RNA表達數據庫

RNA表達數據庫是通過對NCBI上現有的公共數據進行整理、分析,從而構建出一套包含基因名稱、基因表達量等信息的基因表達數據庫。RNA表達數據庫可以在復現實驗分析結果的同時為研究人員提供參考,并結合可視化技術全面展示基因的表達情況與關聯基因信息。

基因表達量 表達量查詢,差異基因篩選

集合了物種不同發育時期、不同組織、不同生物脅迫、不同非生物脅迫等條件下的基因表達數據并根據組織分類,為用戶提供便捷的查詢及分類篩選功能。

可視化表達 圖譜定位,區間展示

在進行基因搜索、選擇操作時,支持以多樣化圖像展示基因的時空表達結果,直觀表現數據關聯。

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DNA變異數據庫

DNA變異數據庫,集合現有的公共重測序數據構建的數據庫,收錄了豐富的樣本表型信息,可以查詢SNP、INDEL在不同群體中的出現頻率。通過DNA變異數據庫,用戶可以查看群體信息、分析群體變異發生比例,輔助群體遺傳變異研究工作。

自定義群體 群體樣本篩選

收錄了物種各類表型信息,用戶可以根據屬性自定義組合群體,動態篩選群體樣本,查詢所有樣本信息的列表。

變異信息展示 群體變異分析

在自定義群組中,可通過基因組位置搜索SNPs/INDELs,查詢SNP和INDEL在不同群體中的出現頻率,結合可視化技術快速了解群體變異情況。

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  • 整合數據庫

整合數據庫

大豆整合數據庫是基于大豆基因組學、轉錄組學及相關數據資源的綜合數據庫,可以為多層面的生命科學研究提供基礎數據查詢和數據可視化服務。本數據庫整合了大豆基因序列、基因結構、基因家族、同源基因、QTL、基因表達、基因變異、共表達網絡、調控網絡等信息,擁有豐富的組學數據和全面的基因信息,可以輔助科研人員便捷地查詢目標基因的整合信息,精準地預測候選基因。

基礎信息一鍵搜索 多樣化信息查詢

借助整合數據庫,用戶不僅可以搜索到基因的基本信息、基因序列、基因結構、基因家族、基因注釋等各項信息,還可以快速查詢基因相關的QTL、基因表達量、SNP/InDel數據。

關聯信息即時獲取 拓展性功能應用

數據庫收錄了豐富的公、私有數據,可以協助用戶獲取基因及其所在家族的所有基因信息,查看基因在其他物種中的同源基因,并構建調控網絡與共表達網絡。

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