產品概況

數據分析是基因研究的重要環節,可交互報告擁有多個模塊報告產品,囊括多種分析算法,為研究人員提供自動分析和可交互結果展示服務,簡化分析流程,有效提高研究工作效率。

產品列表

  • ChIP-Seq報告

  • RNA-Seq報告

  • GWAS報告

ChIP-Seq報告

ChIP-Seq,即結合位點分析法,是轉錄因子和組蛋白研究的重要手段。ChIP-Seq報告基于結合蛋白質的DNA測序,針對測序數據的過濾、統計等流程,向研究人員提供靈活的動態報告,便于用戶從大量Peak中發掘與組蛋白和轉錄因子相互作用的DNA。

數據整合 大數據篩選,信息可視化

在進行基因組研究時,可協助篩選Peak分布數據,并對結果進行可視化展示,專業便捷的工具讓分析結果一目了然。

關聯注釋數據庫

報告系統直接關聯最新的注釋數據庫,通過數據交互,為用戶提供“分析結果-基因-注釋”的便捷性導航,實用性超高。

RNA-Seq報告

RNA-Seq,即轉錄組測序技術,轉錄組研究能夠從整體水平研究基因功能以及基因結構。RNA-Seq報告擁有轉錄本結構預覽、差異基因篩選、蛋白互作網絡等分析模塊,為研究人員提供差異基因篩選、數據重新繪圖等功能,便捷化的操作可以有效提高報告解讀效率。

表格篩選 定向篩選,精準查詢

便捷的差異基因篩選功能,可進行自定義閾值設置,快速獲取目標基因。

圖像重繪 圖表轉化,實時互生

獲取目標數據后,研究人員可指定表格數據,重新繪制統計圖,在圖表交互操作中可展示對應數據。

GWAS報告

全基因組關聯分析(GWAS),是研究基因與表型關系的重要手段。GWAS報告通過大數據可視化、多組學整合分析等方法幫助用戶準確、高效的定位和篩選候選基因,支持對千萬級SNP位點及關聯信息的精準查詢。

數據定點查詢 多點定位,報告可視化

用戶通過可交互的曼哈頓圖、連鎖不平衡圖、Q-Q圖直接查詢顯著SNP位點的詳細信息并添加標注,可一鍵生成包含SNP位點與關聯信息的高質量圖片和表格,以供論文發表。

多樣化分析方法 圖表轉化,實時互生

系統集成多種軟件與分析流程,研究人員通過對不同軟件分析結果的比較,選擇最佳分析方案。

候選基因推薦 關聯數據庫,智能推薦

結合多組學數據庫,利用人工智能技術分析基因與性狀的相關性,快速定位候選基因。

  • sRNA-Seq報告

  • 16s rDNA-Seq報告

  • DNA重測序

sRNA-Seq報告

即smallRNA測序,主要用于注釋sRNA及預測新的miRNA。sRNA-Seq報告借助生物信息分析工具與miRBase數據庫資源,為研究人員提供不同樣本的sRNA比對與分析服務,協助獲取不同樣本的sRNA表達,注釋miRNA的靶基因、預測新的miRNA。

sRNA分析鑒定 sRNA定量分析,新miRNA鑒定

通過對細胞或組織中的全部sRNA進行分析,快速鑒定并注釋已知sRNA分子,并根據沒有被注釋上的sRNA預測新的miRNA。

靶基因預測 靶位點預測,關系網絡搭建

根據miRNA比對位置信息預測miRNA作用的靶位點,通過靶位點的位置來對其進行靶基因分析, 并搭建miRNA-mRNA關系網絡,協助探索miRNA 功能。

16s rDNA-Seq報告

16s rDNA擴增子測序,在環境微生物群落結構研究中扮演著重要角色。16s rDNA-Seq報告借助PCR擴增及多樣性分析手段,對變異區域的高變區進行測序分析和菌種鑒定,幫助用戶快速確定群落物種, 尋找標志性菌群或特定功能的基因。

OTU聚類分析 聚類統計,分類鑒定

可對變異區序列進行聚類統計,根據序列差異將不同的細菌分類,并依據每個OTU對應的不同微生物種屬,快速對樣品中的微生物種進行注釋及豐度分析,揭示樣品物種構成。

多樣性指數 全方位分析,多維度統籌

結合α多樣性分析與β多樣性分析手段,從整體探討不同生境的微生物群落異質性,協助用戶挖掘樣品之間的差異。

DNA重測序

通過對已知基因組序列的物種進行不同個體的基因組測序,在此基礎上分析個體或群體水平序列差異性。DNA重測序可以協助研究人員了解生物群體的遺傳特征,實現重要性狀候選基因預測,推動在群體水平上進行物種的起源進化、環境適應性、自然選擇和人工選擇等方面的研究。

變異檢測 群體檢測,獲取變異信息

采用 GATK 工具包對樣品進行群體檢測,找到SNP位點,插入InDel位點,統計分布結果,并根據參考基因組序列對檢測到的變異信息進行注釋。

遺傳分析 群體變異信息,多樣性分析

通過基因組重測序我們可以得到群體內大量的遺傳變異信息,從而進行系統發育樹、群體結構、群體主成分等遺傳進化分析。

產品優勢

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